Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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