Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE3CQ15386 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.5 ms