Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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SHPRHQ149N8 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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SHPRHQ149N8 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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SHPRHQ149N8 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
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SHPRHQ149N8 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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SHPRHQ149N8 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.32
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SHPRHQ149N8 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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