Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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PKP1Q13835 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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PKP1Q13835 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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PKP1Q13835 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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PKP1Q13835 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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PKP1Q13835 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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