Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms