Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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