Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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