Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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