Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SKP2Q13309 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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SKP2Q13309 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
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SKP2Q13309 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
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SKP2Q13309 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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SKP2Q13309 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
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SKP2Q13309 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
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SKP2Q13309 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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SKP2Q13309 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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SKP2Q13309 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
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SKP2Q13309 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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SKP2Q13309 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SKP2Q13309 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
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