Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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