Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CTIFO43310 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CTIFO43310 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CTIFO43310 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CTIFO43310 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CTIFO43310 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CTIFO43310 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CTIFO43310 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CTIFO43310 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CTIFO43310 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTIFO43310 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTIFO43310 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTIFO43310 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CTIFO43310 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTIFO43310 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTIFO43310 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTIFO43310 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTIFO43310 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTIFO43310 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTIFO43310 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTIFO43310 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTIFO43310 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTIFO43310 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTIFO43310 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CTIFO43310 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTIFO43310 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTIFO43310 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CTIFO43310 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTIFO43310 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTIFO43310 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTIFO43310 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTIFO43310 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTIFO43310 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTIFO43310 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTIFO43310 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CTIFO43310 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTIFO43310 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTIFO43310 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CTIFO43310 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTIFO43310 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CTIFO43310 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CTIFO43310 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CTIFO43310 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CTIFO43310 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
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