Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms