Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf78Q9NZ63 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf78Q9NZ63 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf78Q9NZ63 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf78Q9NZ63 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf78Q9NZ63 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf78Q9NZ63 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf78Q9NZ63 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf78Q9NZ63 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf78Q9NZ63 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf78Q9NZ63 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf78Q9NZ63 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf78Q9NZ63 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf78Q9NZ63 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf78Q9NZ63 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf78Q9NZ63 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf78Q9NZ63 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf78Q9NZ63 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf78Q9NZ63 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf78Q9NZ63 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf78Q9NZ63 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf78Q9NZ63 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf78Q9NZ63 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf78Q9NZ63 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf78Q9NZ63 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf78Q9NZ63 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf78Q9NZ63 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf78Q9NZ63 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
C9orf78Q9NZ63 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C9orf78Q9NZ63 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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