Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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HOXD1Q9GZZ0 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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HOXD1Q9GZZ0 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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HOXD1Q9GZZ0 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
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HOXD1Q9GZZ0 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.59□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
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HOXD1Q9GZZ0 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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HOXD1Q9GZZ0 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD1Q9GZZ0 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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