Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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