Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRIM63Q969Q1 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms