Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms