Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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CDO1Q16878 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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CDO1Q16878 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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CDO1Q16878 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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