Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ME3Q16798 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ME3Q16798 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ME3Q16798 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ME3Q16798 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ME3Q16798 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ME3Q16798 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ME3Q16798 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ME3Q16798 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ME3Q16798 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ME3Q16798 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ME3Q16798 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ME3Q16798 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ME3Q16798 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ME3Q16798 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ME3Q16798 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ME3Q16798 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ME3Q16798 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ME3Q16798 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ME3Q16798 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ME3Q16798 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ME3Q16798 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ME3Q16798 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ME3Q16798 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ME3Q16798 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ME3Q16798 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ME3Q16798 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ME3Q16798 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ME3Q16798 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
ME3Q16798 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ME3Q16798 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ME3Q16798 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ME3Q16798 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ME3Q16798 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ME3Q16798 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ME3Q16798 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ME3Q16798 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ME3Q16798 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ME3Q16798 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ME3Q16798 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ME3Q16798 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ME3Q16798 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ME3Q16798 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ME3Q16798 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ME3Q16798 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ME3Q16798 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ME3Q16798 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ME3Q16798 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ME3Q16798 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ME3Q16798 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ME3Q16798 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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ME3Q16798 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ME3Q16798 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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ME3Q16798 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ME3Q16798 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ME3Q16798 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ME3Q16798 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
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ME3Q16798 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ME3Q16798 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ME3Q16798 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ME3Q16798 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ME3Q16798 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ME3Q16798 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ME3Q16798 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ME3Q16798 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ME3Q16798 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ME3Q16798 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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ME3Q16798 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ME3Q16798 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ME3Q16798 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ME3Q16798 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ME3Q16798 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ME3Q16798 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ME3Q16798 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ME3Q16798 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ME3Q16798 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ME3Q16798 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ME3Q16798 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ME3Q16798 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ME3Q16798 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ME3Q16798 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ME3Q16798 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ME3Q16798 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ME3Q16798 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ME3Q16798 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ME3Q16798 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ME3Q16798 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ME3Q16798 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ME3Q16798 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ME3Q16798 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ME3Q16798 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ME3Q16798 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ME3Q16798 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ME3Q16798 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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