Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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