Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TAF1AQ15573 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TAF1AQ15573 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 358.4 ms