Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
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