Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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DDX39BQ13838 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
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DDX39BQ13838 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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DDX39BQ13838 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
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DDX39BQ13838 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
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DDX39BQ13838 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
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DDX39BQ13838 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DDX39BQ13838 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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