Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RUNX3Q13761 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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