Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ATP1A4Q13733 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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