Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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CDH18Q13634 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
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