Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRQ13535 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRQ13535 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRQ13535 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRQ13535 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRQ13535 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRQ13535 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRQ13535 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRQ13535 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRQ13535 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRQ13535 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRQ13535 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRQ13535 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRQ13535 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRQ13535 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRQ13535 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRQ13535 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRQ13535 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRQ13535 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATRQ13535 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATRQ13535 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATRQ13535 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATRQ13535 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATRQ13535 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATRQ13535 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATRQ13535 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
ATRQ13535 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATRQ13535 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
ATRQ13535 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATRQ13535 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATRQ13535 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATRQ13535 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
ATRQ13535 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
ATRQ13535 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
ATRQ13535 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
ATRQ13535 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
ATRQ13535 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
ATRQ13535 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.4□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.34
ATRQ13535 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
ATRQ13535 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
ATRQ13535 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.34
ATRQ13535 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ATRQ13535 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ATRQ13535 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC0.4□□□□□ -2.35
ATRQ13535 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ATRQ13535 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
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