Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
MKRN4PQ13434 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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