Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SP140Q13342 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SP140Q13342 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SP140Q13342 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SP140Q13342 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
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SP140Q13342 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SP140Q13342 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SP140Q13342 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
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SP140Q13342 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SP140Q13342 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SP140Q13342 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SP140Q13342 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
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SP140Q13342 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
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SP140Q13342 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SP140Q13342 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SP140Q13342 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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SP140Q13342 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SP140Q13342 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SP140Q13342 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SP140Q13342 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SP140Q13342 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SP140Q13342 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SP140Q13342 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SP140Q13342 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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