Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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