Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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CHAF1BQ13112 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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CHAF1BQ13112 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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CHAF1BQ13112 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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