Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CENPFP49454 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
CENPFP49454 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CENPFP49454 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CENPFP49454 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
CENPFP49454 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CENPFP49454 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
CENPFP49454 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
CENPFP49454 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CENPFP49454 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CENPFP49454 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CENPFP49454 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CENPFP49454 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CENPFP49454 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CENPFP49454 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CENPFP49454 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
CENPFP49454 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
CENPFP49454 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CENPFP49454 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CENPFP49454 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CENPFP49454 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CENPFP49454 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
CENPFP49454 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
CENPFP49454 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CENPFP49454 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CENPFP49454 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CENPFP49454 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CENPFP49454 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CENPFP49454 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
CENPFP49454 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CENPFP49454 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
CENPFP49454 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC-0.15□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
CENPFP49454 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC-0.15□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
CENPFP49454 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CENPFP49454 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CENPFP49454 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CENPFP49454 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
CENPFP49454 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CENPFP49454 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
CENPFP49454 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
CENPFP49454 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
CENPFP49454 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
CENPFP49454 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
CENPFP49454 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
CENPFP49454 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CENPFP49454 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CENPFP49454 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CENPFP49454 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CENPFP49454 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CENPFP49454 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
CENPFP49454 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CENPFP49454 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CENPFP49454 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CENPFP49454 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CENPFP49454 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CENPFP49454 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CENPFP49454 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CENPFP49454 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
CENPFP49454 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CENPFP49454 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms