Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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