Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRGP23470 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.6 ms