Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
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