Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC0.07□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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