Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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CCDC47Q96A33 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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CCDC47Q96A33 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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