Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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