Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTF1Q16619 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms