Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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