Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
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SCN9AQ15858 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
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