Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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NECTIN1Q15223 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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NECTIN1Q15223 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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NECTIN1Q15223 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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