Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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