Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
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ITGB3BPQ13352 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
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ITGB3BPQ13352 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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ITGB3BPQ13352 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
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ITGB3BPQ13352 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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ITGB3BPQ13352 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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ITGB3BPQ13352 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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ITGB3BPQ13352 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
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ITGB3BPQ13352 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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