Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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