Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
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GRIK3Q13003 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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GRIK3Q13003 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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GRIK3Q13003 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
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GRIK3Q13003 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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