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| FOXL1 | Q12952 | COPS2-202 | ENST00000388901 | 6628 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.84 | | |
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| FOXL1 | Q12952 | RPS26P15-201 | ENST00000488067 | 348 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
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| FOXL1 | Q12952 | AC008243.1-201 | ENST00000504955 | 389 nt | TSL 3 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
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| FOXL1 | Q12952 | AC109479.2-201 | ENST00000517842 | 174 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
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| FOXL1 | Q12952 | AC013799.1-201 | ENST00000531157 | 348 nt | TSL 2 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
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| FOXL1 | Q12952 | AC103996.1-201 | ENST00000555468 | 102 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
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| FOXL1 | Q12952 | MIR4429-201 | ENST00000580105 | 73 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | AC004147.1-201 | ENST00000580658 | 299 nt | TSL 3 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | LINC01630-204 | ENST00000582689 | 539 nt | TSL 4 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | AC087749.1-202 | ENST00000585020 | 566 nt | TSL 2 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | AC006557.5-201 | ENST00000603126 | 811 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | AL355877.2-201 | ENST00000603670 | 358 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | AC006077.1-201 | ENST00000604746 | 343 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | AL591034.3-201 | ENST00000605511 | 685 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | AC009318.2-201 | ENST00000610917 | 651 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | AL138721.1-201 | ENST00000616756 | 179 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | AC013727.1-201 | ENST00000618581 | 839 nt | TSL 5 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | AL359313.1-202 | ENST00000635073 | 544 nt | TSL 4 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | AP003481.1-201 | ENST00000637808 | 351 nt | TSL 5 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | CACNB4-257 | ENST00000637547 | 7658 nt | TSL 5 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | NFIB-203 | ENST00000380934 | 2142 nt | TSL 2 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | MECOM-219 | ENST00000628990 | 4835 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | RNF38-201 | ENST00000259605 | 5012 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | SLC15A5-201 | ENST00000344941 | 2923 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | OR52E4-202 | ENST00000641726 | 2947 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | PLS3-203 | ENST00000420625 | 3150 nt | TSL 5 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | STON1-GTF2A1L-202 | ENST00000394754 | 3824 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | ZMYND11-217 | ENST00000627286 | 3914 nt | TSL 5 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | LINC01505-206 | ENST00000637046 | 4266 nt | TSL 5 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | SPRR2C-201 | ENST00000290702 | 219 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | MUCL1-201 | ENST00000308796 | 470 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | Y_RNA.20-201 | ENST00000362479 | 113 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | Y_RNA.117-201 | ENST00000363294 | 101 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | Y_RNA.245-201 | ENST00000364493 | 95 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | RNU6-200P-201 | ENST00000364743 | 107 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | RNU1-13P-201 | ENST00000384499 | 162 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | PPIAP31-201 | ENST00000405422 | 495 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | RPL21P38-201 | ENST00000418090 | 167 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | AC069079.1-201 | ENST00000419889 | 400 nt | TSL 3 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | NDUFB4P7-201 | ENST00000423198 | 363 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | Z75746.1-201 | ENST00000440243 | 2080 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXL1 | Q12952 | AC013470.1-201 | ENST00000453438 | 462 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |