Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms