Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC0□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC0□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC0□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC0□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC0□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC-0□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC-0□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC-0□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms