Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms